李俊桦研究员以《Building Scalable Infrastructure for Human Microbiome Research》为题展开报告,分享了团队在人类微生物组研究资源与方法体系构建方面的研究与进展。李俊桦研究员首先介绍了团队在肠道菌群参考资源建设方面的工作,包括整合基因目录(Integrated Gene Catalog,IGC)和可培养基因组参考资源(Culturable Genome Reference,CGR),以及这些资源在人群研究、疾病风险评估和干预效果分析中的应用。随后,报告重点聚焦肠道病毒组研究面临的关键挑战,包括参考数据库不完整、噬菌体与宿主关系难以解析以及病毒蛋白功能注释不足等问题。针对这些问题,团队构建了肠道菌群资源库(Gut Phage Biobank,GPB),开发了病毒组分析工具SinProVirP和噬菌体宿主识别工具VirHost Hunter,并介绍了正在推进的病毒蛋白功能注释框架VIPER。相关工作为肠道病毒的检测、定量分析、宿主关联解析等提供了重要支撑。最后,介绍了基础模型在微生物组研究中的应用前景,提出联邦基础模型框架(Federated Foundation Model,FFM),该框架通过联邦学习实现多队列协同建模,在保护原始数据隐私的前提下促进微生物组大规模知识学习与共享。本次报告系统梳理了从肠道菌群参考资源建设、肠道病毒组研究到人工智能模型应用等方面的研究进展,展现了资源、方法与模型协同推动领域发展的前沿趋势。
李俊桦博士
现任深圳华大生命科学研究院研究员、分院副院长,兼任深圳市未知病原体应急检测重点实验室主任、中国科学院大学硕士生导师、华南理工大学博士生导师。李博士长期从事人体微生物组、病毒组与生物信息学方法研究,致力于构建面向大规模队列和跨研究比较的微生物组数据资源与分析方法体系,推动人体微生物组研究从数据积累走向机制发现、精准干预和可转化应用。迄今以第一作者或通讯作者身份在 Nature Biotechnology、Nature Ecology & Evolution、Cell Host & Microbe、Nature Medicine 等国际期刊发表论文 40 余篇,Scopus H-index 为 44;连续多年入选科睿唯安“全球高被引科学家”(2019、2020、2025)和斯坦福大学/Elsevier“全球前 2% 顶尖科学家”(2022–2025)。李博士重视科研成果转化与标准化建设,已获授权发明专利 16 项;牵头制定国际标准 ISO/TS 20853,参与制定国家标准 GB/T 40226-2021 和 GB/T 43628-2023,推动微生物组检测与噬菌体应用的规范化发展。相关成果获 2021 年中国产学研合作创新成果奖一等奖。李博士同时担任国际标准化组织生物技术委员会(ISO/TC 276)专家成员、国际百万微生态计划(MMHP)联席主席,以及 Frontiers in Medicine、Frontiers in Public Health、Microbiology Spectrum 编委,并长期担任 Nature Reviews Bioengineering、Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology、Cell Host & Microbe、Cell Metabolism、Nature Aging 等国际期刊审稿人。
初审 | 施少怀
复审 | 漆舒汉
终审 | 王 轩